Kei Satoは、5年前に彼の次の大きな挑戦を探していました。ウイルス科医は最近、東京大学で独立したグループを設立し、HIV研究の混雑した分野でニッチを切り開けようとしていました。 「「今後20年または30年の間、何ができるの？」
彼はsars - cov - 2で答えを見つけました。 世界中に急速に広がっています。 2020年3月、東京は研究活動を止める封鎖に直面する可能性があるという噂が渦巻いたため、佐藤と5人の学生が京都の元顧問の研究室に移りました。そこで、彼らはsars - cov - 2を使用するウイルスタンパク質の研究を開始しました 体の最も早い免疫応答を鎮圧します。佐藤はすぐに、ウイルスに関する少なくとも50の研究を公開する研究者のコンソーシアムを設立しました。
わずか5年で、SARS - COV - 2は、地球上で最も綿密に検査されたウイルスの1つになりました。引用データベースScopusによると、研究者はそれに関する約150,000の研究記事を公開しています。これは、同じ期間にHIVに掲載された論文の約3倍です。科学者はまた、他のどの生物よりも多く、これまでに1700万sars - cov - 2ゲノム配列を生成しました。これにより、感染が広がるにつれてウイルスが変化する方法について、比類のない見解が得られました。 「以前に達成できるよりもはるかに高い解像度でパンデミックをリアルタイムで見る機会がありました」と、英国近くのピルブライト研究所のウイルス学者であるトム・ピーコックは言います。
さて、後部のパンデミックの緊急段階で-ビューミラーを見ると、ウイルス学者は、このような短い時間でウイルスについて学べることを理解しています。 その進化 そして、人間の宿主との相互作用。パンデミックからの4つの教訓があります。 将来のパンデミックに対するグローバルな対応 - しかし、科学的および公共の機関がそれらを使用するために整っている場合にのみ。
バイラルシーケンスはストーリーを伝えます
2020年1月11日、オーストラリアのシドニー大学のウイルス学者であるエドワード・ホームズは、ほとんどの科学者が最初のSARS - COV - 2ゲノムシーケンスと考えているものをウイルス学ディスカッション委員会のゲノムシーケンスと共有しました。彼はウイルス科医からデータを受け取っていました 中国のチャン・ヨンゲン.
年末までに、科学者は300,000を超えるシーケンスを次のように知られるリポジトリに提出していました すべてのインフルエンザデータの共有に関するグローバルイニシアチブ （gisaid）。ウイルスの厄介なバリアントが定着したため、データ収集の速度はそこから速くなりました。一部の国は、sarsのシーケンスに膨大な資源を耕しました。一方、南アフリカ、インド、ブラジルを含む他の国の科学者は、効率的な監視が低いリソース設定で心配なバリアントを見つけることができることを示しました。
2013〜16年の西アフリカのエボラの発生などの初期の流行では、シーケンスデータは、感染が広がるにつれてウイルスがどのように変化しているかを追跡するにはゆっくりとなりました。しかし、バーゼルのスイストロピカルアンドパブリックヘルスインスティテュートのゲノム疫学者であるエマホッドクロフトは、SARS - cov - 2シーケンスが前例のないボリュームとペースに到達することがすぐに明らかになりました。彼女は取り組んでいます NextStrainと呼ばれる努力、ゲノムデータを使用して、インフルエンザなどのウイルスを追跡して、その拡散をよりよく理解しています。 「私たちはこれらの方法の多くを開発していたので、理論的には非常に便利だったかもしれません」とHodcroft氏は言います。 「そして、2020年に突然、私たちは我慢して現れる機会がありました。」
最初に、SARS - COV - 2シーケンスデータが使用されました その震源地でウイルスの拡散を追跡します 中国のウハン、そして世界的に。これは、ウイルスが主に人間の間に広がるか、同じ動物源から人間に広がるかなど、重要な初期の質問に答えました。このデータは、ウイルスが移動した地理的ルートを明らかにし、従来の疫学的調査よりもはるかに速くそれらを示しました。その後、より速く-ウイルスの送信バリアントが現れ始め、シーケンスラボをHyperDriveに送信しました。科学者とアマチュアバリアントトラッカーのグローバル集団は、心配なウイルスの変化を求めて常にシーケンスデータを介してトロールされました。
ワシントン州シアトルのフレッド・ハッチンソンがんセンターのウイルス進化生物学者であるジェシー・ブルームは、次のように述べています。何百万ものSARS - COV - 2ゲノムを手元に置いて、研究者は戻ってそれらを研究して、ウイルスの進化に関する制約を理解することができます。 「それは私たちがこれまでにできなかったことです」とHodcroft氏は言います。
ウイルスは予想以上に変化します
誰もSars - cov - 2を研究したことがなかったので、科学者はそれがどのように適応するかについて彼ら自身の仮定を持って来ました。多くは、呼吸器感染症を引き起こす別のRNAウイルスの経験に導かれました：インフルエンザ。 「私たちは、パンデミックを引き起こす可能性のある他の呼吸器ウイルスに関する情報をあまり持っていませんでした」とHodcroft氏は言います。
インフルエンザは主に広がります 突然変異の獲得これにより、人々の免疫を回避できます。 2019年以前にSARSに感染した人はいなかったため、多くの科学者は、感染症またはより良い予防接種を通じて、人々の免疫システムによってかなりの圧力がかかるまで、多くのウイルスの変化が見られることを期待していませんでした。
AlphaやDeltaなどのSARS - COV - 2のより速い-送信、より致命的なバリアントの出現は、いくつかの早期の仮定を消し去りました。 2020年初頭まででさえ、SARS - cov - 2は、その広がりを大幅に高めた単一のアミノ-酸の変化を取り上げていました。他の多くの人が続くでしょう。
「私が間違っていて、予想していなかったのは、表現型にどれだけ変化するかということでした」とホームズは言います。 「あなたは、この驚くべき加速と感染性と病原性を見ました。」これは、SARS - COV - 2が、数百万の都市であるWuhanに現れたときに、人々の間で広がることに特に適していないことを示唆しました。密度の低い人口の少ない設定では、非常によく燃え上がる可能性があると彼は付け加えます。
ホームズはまた、観察された変化の猛烈なペースが、どれだけ厳密にsars - cov - 2が追跡されたかの産物であるかどうかを疑問に思います。研究者は、同じ決議で、人口にとって新しいインフルエンザ株の出現を見た場合、同じ割合を見るでしょうか？それはまだ決定されていません。
SARS - cov - 2が取った最初の巨大な飛躍は、1つの節約の恵みをもたらしました。ワクチンと以前の感染症によって送達された保護免疫に劇的に影響しませんでした。しかし、それは2021年後半にオミクロンバリアントの出現とともに変化しました。これは、抗体応答をかわすのに役立つ「スパイク」タンパク質の変化が積まれていました（スパイクタンパク質により、ウイルスは宿主細胞に入ることができます）。ブルームなどの科学者は、これらの変化が連続したポスト-オミクロンバリアントにどれほど速く現れたかに驚いています。
そして、それはオミクロンの最も驚くべき側面でさえありませんでした、と英国ケンブリッジ大学のウイルス学者であるラビンドラ・グプタは言います。バリアントが出現して間もなく、彼のチームと他の人たちは、肺の下部気道細胞を支持する以前のSARS - COV - 2つのバリアントとは異なり、オミクロンは上気道に感染することを好むことに気付きました。 「パンデミックの過程でウイルスが生物学的行動をシフトしたことを文書化することは前例のないものでした」とグプタは言います。
投稿時間：2025 - 05 - 26 13:59:39
