Kei Sato estaba buscando su próximo gran desafío hace cinco años cuando lo golpeó, y el mundo, en la cara. El virólogo había comenzado recientemente un grupo independiente en la Universidad de Tokio e intentaba forjar un nicho en el concurrido campo de la investigación del VIH. "Pensé:" ¿Qué puedo hacer durante los próximos 20 o 30 años? "
Encontró una respuesta en SARS - Cov - 2, el virus responsable de la covid - 19 pandemia, que fue extendiéndose rápidamente por todo el mundo. En marzo de 2020, cuando los rumores se arremangaron de que Tokio podría enfrentar un bloqueo que detendría las actividades de investigación, Sato y cinco estudiantes se desvanecieron a un ex alumno de asesor en Kioto. Allí, comenzaron a estudiar una proteína viral que Sars - Cov - 2 usa para Quelle las primeras respuestas inmunes del cuerpo. Sato pronto estableció un consorcio de investigadores que publicarían al menos 50 estudios sobre el virus.
En solo cinco años, SARS - Cov - 2 se convirtió en uno de los virus más examinados del planeta. Los investigadores han publicado alrededor de 150,000 artículos de investigación al respecto, según la base de datos Citation Scopus. Eso es aproximadamente tres veces el número de artículos publicados en el VIH en el mismo período. Los científicos también han generado más de 17 millones de secuencias de genoma SARS - Cov - 2 hasta ahora, más que para cualquier otro organismo. Esto ha dado una visión incomparable de las formas en que el virus cambió a medida que las infecciones se propagan. "Hubo una oportunidad para ver una pandemia en tiempo real en una resolución mucho más alta que la que se ha logrado antes", dice Tom Peacock, virólogo del Instituto Pirbright, cerca de Woking, Reino Unido.
Ahora, con la fase de emergencia de la pandemia en el espejo trasero - Vista, los virólogos están haciendo un balance de lo que se puede aprender sobre un virus en tan poco tiempo, incluido su evolución y sus interacciones con huéspedes humanos. Aquí hay cuatro lecciones de la pandemia que algunos dicen que podrían empoderar al Respuesta global a las futuras pandemias - pero solo si las instituciones científicas y públicas - salud existen para usarlas.
Las secuencias virales cuentan historias
El 11 de enero de 2020, Edward Holmes, virólogo de la Universidad de Sydney, Australia, compartió lo que la mayoría de los científicos consideran la primera secuencia del genoma SARS - 2 para un tablero de discusión de Virology; había recibido los datos del virólogo Zhang Yongzhen en China.
Al final del año, los científicos habían presentado más de 300,000 secuencias a un repositorio conocido como el Iniciativa global sobre cómo compartir todos los datos de influenza (GISAID). La tasa de recopilación de datos solo se hizo más rápida desde allí a medida que las variantes preocupantes del virus se apoderaron. Algunos países araron enormes recursos en la secuencia SARS - COV - 2: Entre ellos, el Reino Unido y los Estados Unidos contribuyeron con más de 8.5 millones (ver "Rally del genoma viral"). Mientras tanto, los científicos de otros países, incluidos Sudáfrica, India y Brasil, mostraron que la vigilancia eficiente puede detectar variantes preocupantes en la configuración de recursos más bajos.
En epidemias anteriores, como el brote de ébola de África Occidental 2013-16, los datos de secuenciación llegaron demasiado lentamente para rastrear cómo el virus cambiaba a medida que se propagaba las infecciones. Pero rápidamente quedó claro que las secuencias SARS - Cov - 2 llegarían a un volumen y ritmo sin precedentes, dice Emma Hodcroft, epidemióloga genómica del Instituto de Salud Tropical y Pública Suiza en Basilea. Ella trabaja en Un esfuerzo llamado NextStrain, que utiliza datos del genoma para rastrear virus, como la influenza, para comprender mejor su propagación. "Habíamos desarrollado tantos de estos métodos que, en teoría, podrían haber sido muy útiles", dice Hodcroft. "Y de repente, en 2020, tuvimos la oportunidad de levantarnos y aparecer".
Inicialmente, los datos de secuenciación SARS - COV - 2 se utilizaron para Trace la propagación del virus en su epicentro en Wuhan, China, y luego a nivel mundial. Esto respondió las primeras preguntas clave, como si el virus se propagó en gran medida entre las personas o de las mismas fuentes animales a los humanos. Los datos revelaron las rutas geográficas a través de las cuales viajaba el virus, y los mostró mucho más rápido que las investigaciones epidemiológicas convencionales. Más tarde, las variantes de transmisión más rápidas del virus comenzaron a aparecer, y enviaron laboratorios de secuenciación a hiperdrive. Un colectivo global de científicos y rastreadores de variantes aficionados rastreados a través de los datos de secuencia constantemente en busca de cambios virales preocupantes.
"Se hizo posible rastrear la evolución de este virus con tremendo detalle para ver exactamente lo que estaba cambiando", dice Jesse Bloom, un biólogo evolutivo viral del Centro de Cáncer Fred Hutchinson en Seattle, Washington. Con millones de SARS - Cov - 2 genomas en la mano, los investigadores ahora pueden regresar y estudiarlos para comprender las restricciones en la evolución del virus. "Eso es algo que nunca hemos podido hacer antes", dice Hodcroft.
Los virus cambian más de lo esperado
Debido a que nadie había estudiado SARS - Cov - 2 antes, los científicos vinieron con sus propios supuestos sobre cómo se adaptaría. Muchos fueron guiados por experiencias con otro virus de ARN que causa infecciones respiratorias: la influenza. "Simplemente no teníamos mucha información sobre otros virus respiratorios que podrían causar pandemias", dice Hodcroft.
La influenza se extiende principalmente a través del adquisición de mutacionesEso le permite evadir la inmunidad de las personas. Debido a que nadie había sido infectado con SARS - COV - 2 antes de 2019, muchos científicos no esperaban ver mucho cambio viral hasta después de que hubo una presión sustancial que los sistemas inmunes de las personas, ya sea a través de infecciones o mejor aún, vacunación.
La aparición de variantes más rápidas de transmisión, más mortales de SARS - Cov - 2, como alfa y delta, borró algunos supuestos tempranos. Incluso a principios de 2020, SARS - Cov - 2 había recogido un solo cambio de amino - ácido que aumentó sustancialmente su propagación. Muchos otros seguirían.
"Lo que me equivocé y no anticipé fue cuánto cambiaría fenotípicamente", dice Holmes. "Viste esta increíble aceleración en la transmisibilidad y la virulencia". Esto sugirió que SARS - Cov - 2 no estaba especialmente bien adaptado a la propagación entre las personas cuando surgió en Wuhan, una ciudad de millones. Bien podría haberse esfumado en un entorno menos densamente poblado, agrega.
Holmes se pregunta, también, si el ritmo vertiginoso del cambio observado fue simplemente un producto de cuán estrechamente se rastreó SARS - Cov - 2. ¿Los investigadores verían la misma tasa si observaran la aparición de una cepa de influenza que era nueva para la población, a la misma resolución? Eso queda por determinar.
Los saltos gigantes iniciales que Sars - Cov - 2 tomó vinieron con una gracia salvadora: no afectaron drásticamente la inmunidad protectora entregada por vacunas e infecciones anteriores. Pero eso cambió con la aparición de la variante Omicron a fines de 2021, que estaba cargada de cambios en su proteína "espiga" que lo ayudó a esquivar las respuestas de anticuerpos (la proteína de pico permite que el virus ingrese a las células huésped). Los científicos como Bloom se han desconcertado por la rapidez con que aparecieron estos cambios en las sucesivas variantes de Post - Omicron.
Y ese ni siquiera fue el aspecto más sorprendente de Omicron, dice Ravindra Gupta, virólogo de la Universidad de Cambridge, Reino Unido. Poco después de que surgiera la variante, su equipo y otros notaron que, a diferencia de las variantes anteriores de SARS - Cov - 2, como Delta que favorecían las células inferiores de las vías respiratorias del pulmón, Omicron prefería infectar las vías respiratorias superiores. "Documentar que un virus cambió su comportamiento biológico durante el curso de una pandemia no tenía precedentes", dice Gupta.
Tiempo de publicación: 2025 - 05 - 26 13:59:39
