Кеи Сато је тражио свој следећи велики изазов пре пет година када га је ударио - и свет - у лице. Виролог је недавно започео независну групу на Универзитету у Токију и покушавао је да исмева нишу у препуном пољу истраживања ХИВ-а. "Мислио сам:" Шта могу да учиним у наредних 20 или 30 година? "
Пронашао је одговор у САРС-у - Цов - 2, вирус одговоран за присланику - 19 пандемија, то је било брзо се шири широм света. У марту 2020. године, како су се преклињеле да би Токио могла суочити се са закључавањем која би зауставила истраживачке активности, САТО и пет ученика опаговало је у лабораторију за бивше саветнике у Кјоту. Тамо су почели да проучавају вирусни протеин који САРС - ЦОВ - 2 користи Куели су најранији имуни одговори тела. Сато је убрзо основао конзорцијум истраживача који би наставили да објављују најмање 50 студија о вирусу.
У само пет година, САРС - Цов - 2 постао је један од најпознатијих вируса на планети. Истраживачи су објавили око 150.000 истраживачких чланака о томе, у складу са Сцопусом базе података ЦИТИТ-а. То је отприлике три пута више од броја радова објављених на ХИВ-у у истом периоду. Научници су такође створили више од 17 милиона САРС - Цов - 2 секвенце генома до сада више него за било који други организам. Ово је дало неуспоредиво гледање на начине на који се вирус променио као инфекције шире се. "Постојала је прилика да се у стварном времену виде у реалном времену у много већу резолуцију него што је икада раније достигнуто", каже Том Пеацоцк, виролог у Пирбригхт Институту, у близини Вокинг, Велика Британија.
Сада, са хитном фазом пандемије у стражњим - мерогу, виролози воде шта се може научити о вирусу у тако кратко време, укључујући његова еволуција и његове интеракције са људским домаћинима. Ево четири лекције од пандемије које неки кажу да би могао оснажити Глобални одговор на будуће пандемије - Али само ако су на снази научне и јавне здравствене установе да их користе.
Вирусне секвенце причају приче
Дана 11. јануара 2020. године, Едвард Холмес, виролог на Универзитету у Сиднеју, у Аустралији, делио је оно што већина научника сматра првим САРС-ом - Цов 2 генома секвенца виролошког дискусијског одбора; Примио је податке виролога Зханг Ионгзхен у Кини.
До краја године научници су поднели више од 300.000 секвенце на складиште познато као Глобална иницијатива за дељење свих података са грипама (Гисаид). Стопа прикупљања података постала је само брже одатле, јер су се сматрали забрињавајућим варијантима вируса. Неке земље су огрле огромне ресурсе у секвенцирање САРС-а - Цов - 2: Између њих, Уједињено Краљевство и Сједињене Државе допринели су више од 8,5 милиона (види "Вирус Геноме"). У међувремену, научници у другим земљама, укључујући Јужну Африку, Индију и Бразил, показали су да ефикасно надгледање може уочити забрињавајуће варијанте у нижим поставки ресурса.
У ранијим епидемицима, као што су избијање из 2013-16 западне афричке еболе, секвенцирање података су се превише споро дошли да би пратили како се вирус мењао као инфекције шире се. Али брзо је постало јасно да би САРС - 2 секвенце стићи на невиђену количину и темпо, каже Емма Ходцрофт, геномски епидемиолог на швајцарском Тропском и јавном здравственом институту у Базелу. Она ради на напор који се зове Нектстраин, који користи податке о геному да прате вирусе, попут грипа, како би боље разумели њихово ширење. "Развили смо толико ових метода које би у теорији могли бити веома корисни", каже Ходцрофт. "И одједном смо се у 2020. години имали прилику да се поставимо и појавимо."
У почетку су се у почетку, САРС - ЦОВ - 2 секвенцирајући подаци Пратите ширење вируса на свом епицентру У Вухану, Кини, а потом глобално. Ово је одговорила кључна рана питања - као што јесу ли вирус у великој мери шири између људи или из истих извора животиња на људе. Подаци су открили географске руте кроз које је вирус путовао и показао им много брже него што би могло конвенционалне епидемиолошке истраге. Касније, брже - варијанте преноса вируса почеле су да се појављују и послали су секвенцирајуће лабораторије у хипердриве. Глобални колектив научника и аматерских варијанти трагача трагали су се кроз податке о секвенци стално у потрази за забринутим променама вируса.
"То је постало могуће праћење еволуције овог вируса у огромним детаљима да бисте тачно видели шта се мењало", каже Јессе Блоом, вирусни еволуциони биолог у Фреду Хутцхинсон центру рака у Сијетлу, Вашингтон. Са милионима САРС-а - Цов - 2 геноми у руци, истраживачи се сада могу вратити и проучити их да разумеју ограничења на еволуцији вируса. "То је нешто што никада раније нисмо могли да урадимо", каже Ходцрофт.
Вируси се мењају више него што се очекивало
Јер нико никада није студирао САРС - Цов - 2 пре, научници су дошли са властитим претпоставкама о томе како би се то прилагодило. Многи су вођени искуством са другим РНА вирусом који изазива респираторне инфекције: грипа. "Једноставно нисмо имали много информација о другим респираторним вирусима који могу изазвати пандемије", каже Ходцрофт.
Грип се шири углавном кроз Аквизиција мутацијаТо омогућавају да избегне имунитет људи. Будући да нико никада није био заражен САРС-ом - Ков - 2 пре 2019. године, многи научници нису очекивали да ће видети много вирусних промена тек након што је постојао знатан притисак на њему имуни системи људи, било и још боље, ипак, вакцинација.
Појава бржег - преноса, мртварније варијанте САРС-а - Цов - 2, као што су алфа и делта, избрисане неке ране претпоставке. Чак и почетком 2020. године, САРС - Цов 2 је покупио једну промену амино - киселина која је у великој мери појачала ширење. Многи други би пратили.
"Оно што сам погрешио и нисам очекивао било колико би се фенотипно променило", каже Холмес. "Видели сте то невероватно убрзање у преносној и вируленцији." Ово је сугерисало да САРС - Цов 2 није посебно добро прилагођен да се шири између људи када се појавио у Вухану, граду милионима. То би се могло врло добро замислити у мање густо насељеном поставку, додаје.
Холмес се, такође, да ли је темпо пробијања посматране промене само производ колико је праћен присловски САРС - у праћењу 2. Да ли би истраживачи видели исту стопу ако су гледали настанку соја грипа који је био нови становништву, у истој резолуцији? То остаје да се утврди.
Почетни дивовски скокови који су се САРС - 2 узели дошли су са једном штедњом милошћу: Нису драстично утицали на заштитни имунитет који су испоручени вакцинама и претходним инфекцијама. Али то се променило настанком омиконске варијанте крајем 2021. године, што је било давано изменама у протеину "Спике" који му је помогао да додгне одговоре антитела (протеин шиљке омогућава вирус да уђе у ћелије домаћина). Научници попут цветања били су изненађени колико су се брзо појавиле ове измене у узастопним пост - омицрон варијантима.
А то није био ни најчуднији аспект Омицрона, каже Равиндра Гупта, виролог на Универзитету у Цамбридгеу, Велика Британија. Убрзо након што је изашла варијанта, његов тим и други су приметили да, за разлику од претходних САРС-а - 2 варијанте попут Делта која је фаворизирала доњих - ћелија дисајне путеве плућа, Омицрон је преферирала да зарази у горње дисајне путеве. "Документ да је вирус прешао своје биолошко понашање током пандемије био је без преседана", каже Гупта.
Време: 2025 - 05 - 26 13:59:39
