Kei Sato ishte në kërkim të sfidës së tij të ardhshme të madhe pesë vjet më parë kur e goditi atë - dhe botën - në fytyrë. Virologu kohët e fundit kishte filluar një grup të pavarur në Universitetin e Tokios dhe po përpiqej të krijonte një vend në fushën e mbushur me njerëz të hulumtimit për HIV. "Mendova," canfarë mund të bëj për 20 ose 30 vitet e ardhshme? ""
Ai gjeti një përgjigje në SARS - cov - 2, virusi përgjegjës për Covid - 19 pandemi, kjo ishte duke u përhapur me shpejtësi në të gjithë botën. Në Mars 2020, ndërsa thashethemet u tërhoqën se Tokio mund të përballet me një bllokim që do të ndalonte aktivitetet kërkimore, Sato dhe pesë studentë të dekompozuar në laboratorin e një ish -këshilltari në Kioto. Atje, ata filluan të studiojnë një proteinë virale që SARS - cov - 2 përdor shuar përgjigjet më të hershme imune të trupit. Sato shpejt themeloi një konsorcium studiuesish që do të vazhdonin të publikonin të paktën 50 studime mbi virusin.
Në vetëm pesë vjet, SARS - COV - 2 u bë një nga viruset më të ekzaminuar nga afër në planet. Studiuesit kanë botuar rreth 150,000 artikuj kërkimor në lidhje me të, sipas bazës së të dhënave të citimit Scopus. Kjo është afërsisht tre herë numri i letrave të publikuara në HIV në të njëjtën periudhë. Shkencëtarët gjithashtu kanë gjeneruar më shumë se 17 milion SAR - COV - 2 sekuenca të gjenomit deri më tani, më shumë sesa për çdo organizëm tjetër. Kjo ka dhënë një pamje të pashembullt në mënyrat në të cilat virusi ndryshoi ndërsa përhapet infeksionet. "Kishte një mundësi për të parë një pandemi në kohë reale në rezolucion shumë më të lartë sesa ka qenë ndonjëherë i arritshëm më parë," thotë Tom Peacock, një virolog në Institutin Pirbright, afër Woking, MB.
Tani, me fazën e urgjencës së pandemisë në pasqyrën e pasme - Shiko pasqyrën, virologët po marrin në gjendje atë që mund të mësohet për një virus në një kohë kaq të shkurtër, duke përfshirë evolucioni i saj dhe bashkëveprimet e tij me nikoqirët njerëzorë. Këtu janë katër mësime nga pandemia që disa thonë se mund të fuqizojnë Përgjigja globale ndaj pandemive të ardhshme - por vetëm nëse janë krijuar institucione shkencore dhe publike - Shëndetësia për t'i përdorur ato.
Sekuencat virale tregojnë histori
Më 11 Janar 2020, Edward Holmes, një virolog në Universitetin e Sidneit, Australi, ndau atë që shumica e shkencëtarëve e konsiderojnë si SARS të parë - COV - 2 sekuencë gjenomike në një bord diskutimesh të virologjisë; Ai kishte marrë të dhënat nga virologu Zhang Yongzhen në Kinë.
Deri në fund të vitit, shkencëtarët kishin paraqitur më shumë se 300,000 sekuenca në një depo të njohur si Nisma globale për ndarjen e të gjitha të dhënave të gripit (GISAID). Shkalla e mbledhjes së të dhënave u bë më shpejt nga atje ndërsa variante shqetësuese të virusit u mbajtën. Disa vende lëruan burime të mëdha në renditjen e SARS - COV - 2: Midis tyre, Mbretëria e Bashkuar dhe Shtetet e Bashkuara kontribuan më shumë se 8.5 milion (shiko "Rally Genome Viral"). Ndërkohë, shkencëtarët në vendet e tjera, përfshirë Afrikën e Jugut, Indinë dhe Brazilin, treguan se mbikëqyrja efikase mund të vërejë variante shqetësuese në ambiente më të ulëta - burimesh.
Në epidemitë e mëparshme, siç është shpërthimi i Ebolës në Afrikën Perëndimore 2013–16, të dhënat e sekuencave erdhën shumë ngadalë për të gjurmuar se si virusi po ndryshonte ndërsa përhapet infeksionet. Por shpejt u bë e qartë se sekuencat SARS - COV - 2 do të arrinin në një vëllim dhe ritëm të paparë, thotë Emma Hodcroft, një epidemiiste gjenomike në Institutin Zviceran Tropikal dhe Shëndetit Publik në Basel. Ajo punon në Një përpjekje e quajtur NextStrain, i cili përdor të dhënat e gjenomit për të gjurmuar viruset, të tilla si gripi, për të kuptuar më mirë përhapjen e tyre. "Ne kishim zhvilluar kaq shumë nga këto metoda që, në teori, mund të ishin shumë të dobishme," thotë Hodcroft. "Dhe krejt papritur, në vitin 2020, ne patëm një mundësi për të ngritur dhe paraqitur."
Fillimisht, SARS - COV - 2 të dhëna për sekuencat u përdorën për të gjurmoni përhapjen e virusit në epiqendrën e tij në Wuhan, Kinë, dhe më pas globalisht. Kjo iu përgjigj pyetjeve kryesore të hershme - siç është nëse virusi përhapet kryesisht midis njerëzve ose nga të njëjtat burime të kafshëve te njerëzit. Të dhënat zbuluan rrugët gjeografike përmes të cilave udhëtoi virusi, dhe u treguan atyre shumë më shpejt sesa mund të ishin hetimet konvencionale epidemiologjike. Më vonë, më shpejt - transmetimi i varianteve të virusit filluan të shfaqeshin, dhe dërgoi laboratorë sekuencimi në hiperdrive. Një kolektiv global i shkencëtarëve dhe gjurmuesve të varianteve amatorë shkelnin të dhënat e sekuencës vazhdimisht në kërkim të ndryshimeve virale shqetësuese.
"U bë e mundur të gjurmosh evolucionin e këtij virusi në detaje të jashtëzakonshme për të parë saktësisht se çfarë po ndryshonte," thotë Jesse Bloom, një biolog ivolucionar viral në Qendrën e Kancerit Fred Hutchinson në Seattle, Washington. Me miliona SARS - COV - 2 gjenome në dorë, studiuesit tani mund të kthehen dhe t'i studiojnë ato për të kuptuar kufizimet në evolucionin e virusit. "Kjo është diçka që ne kurrë nuk kemi qenë në gjendje ta bëjmë më parë," thotë Hodcroft.
Viruset ndryshojnë më shumë sesa pritej
Për shkak se askush nuk kishte studiuar kurrë SARS - COV - 2 Më parë, shkencëtarët erdhën me supozimet e tyre se si do të përshtatej. Shumë njerëz u udhëzuan nga përvojat me një virus tjetër të ARN -së që shkakton infeksione të frymëmarrjes: gripi. "Ne thjesht nuk kemi shumë informacione për viruset e tjera të frymëmarrjes që mund të shkaktojnë pandemi," thotë Hodcroft.
Gripi përhapet kryesisht përmes blerja e mutacioneveKjo e lejon atë të shmangë imunitetin e njerëzve. Për shkak se askush nuk ishte infektuar kurrë me SARS - COV - 2 Para vitit 2019, shumë shkencëtarë nuk prisnin të shihnin shumë ndryshime virale derisa pasi të kishte vendosur presion të konsiderueshëm në të nga sistemet imune të njerëzve, qoftë përmes infeksioneve ose më mirë akoma, vaksinimi.
Shfaqja e varianteve më të shpejta - transmetuese, më vdekjeprurëse të SARS - COV - 2, siç janë alfa dhe delta, shkatërruan disa supozime të hershme. Edhe deri në fillim të vitit 2020, SARS - COV - 2 kishte zgjedhur një ndryshim të vetëm amino - acid që rriti në mënyrë të konsiderueshme përhapjen e tij. Shumë të tjerë do të ndiqnin.
"Ajo që unë gabova dhe nuk e parashikoja ishte mjaft se sa do të ndryshonte në mënyrë fenotipike," thotë Holmes. "Ju e keni parë këtë përshpejtim të mahnitshëm në transmetim dhe virulencë." Kjo sugjeroi që SARS - COV - 2 nuk ishte përshtatur veçanërisht mirë për t'u përhapur midis njerëzve kur doli në Wuhan, një qytet me miliona. Mund të ishte shumë mirë në një mjedis më pak të dendur të populluar, shton ai.
Holmes pyes veten gjithashtu, nëse ritmi i mprehtë i ndryshimit të vëzhguar ishte thjesht një produkt se sa nga afër u gjurmua SARS - COV - 2. A do të shohin studiuesit të njëjtën normë nëse ata shikonin shfaqjen e një tendosje të gripit që ishte e re për popullsinë, në të njëjtën rezolutë? Që mbetet për tu përcaktuar.
Kërcitjet fillestare të gjigantit që SARS - COV - 2 u morën me një hir të kursimit: Ata nuk ndikuan në mënyrë drastike në imunitetin mbrojtës të dhënë nga vaksinat dhe infeksionet e mëparshme. Por kjo ndryshoi me shfaqjen e variantit Omicron në fund të vitit 2021, i cili u ngarkua me ndryshime në proteinën e tij ‘spike’ që e ndihmoi atë të shmangej përgjigjet e antitrupave (proteina e pikës lejon që virusi të hyjë në qelizat pritëse). Shkencëtarët si Bloom janë kapur në mënyrë se sa shpejt u shfaqën këto ndryshime në Postimin e njëpasnjëshëm - Variantet Omicron.
Dhe ky nuk ishte as aspekti më befasues i Omicron, thotë Ravindra Gupta, një virolog në Universitetin e Kembrixhit, në Mbretërinë e Bashkuar. Menjëherë pasi u shfaq varianti, ekipi i tij dhe të tjerët vunë re se, ndryshe nga SARS e mëparshme - COV - 2 variante të tilla si Delta që favorizuan qelizat e poshtme - rrugët ajrore të mushkërive, Omicron preferoi të infektonte rrugët e sipërme të ajrit. "Të dokumentosh që një virus zhvendosi sjelljen e tij biologjike gjatë rrjedhës së një pandemie ishte e pashembullt," thotë Gupta.
Koha e postimit: 2025 - 05 - 26 13:59:39
