Kei Sato tražila je svoj sljedeći veliki izazov prije pet godina, kada ga je u licu probijao - i svijet. Virolog je nedavno pokrenuo neovisnu grupu na Sveučilištu u Tokiju i pokušavao je izrezati nišu u prepunom području istraživanja HIV -a. "Mislio sam:" Što mogu učiniti sljedećih 20 ili 30 godina? "
Našao je odgovor u SARS - cov - 2, virus odgovoran za Coid - 19 pandemiju, to je bilo Brzo se širi svijetom. U ožujku 2020. godine, dok su se glasine vrtjele da bi se Tokio mogao suočiti s zaključavanjem koje će zaustaviti istraživačke aktivnosti, Sato i pet studenata koji su se u Kyotu odredili u laboratoriji bivšeg savjetnika. Tamo su počeli proučavati virusni protein koji SARS - COV - 2 koristi Ugušite najraniji imunološki odgovori tijela. Sato je ubrzo uspostavio konzorcij istraživača koji će nastaviti objavljivati najmanje 50 studija o virusu.
U samo pet godina, SARS - CoV - 2 postao je jedan od najapseljenih virusa na planeti. Istraživači su objavili oko 150 000 istraživačkih članaka o tome, prema Scopusu baze podataka. To je otprilike tri puta više od broja radova objavljenih na HIV -u u istom razdoblju. Znanstvenici su također stvorili više od 17 milijuna SARS - CoV - 2 sekvence genoma do sada, više nego za bilo koji drugi organizam. To je dalo neusporediv pogled na načine na koje se virus mijenjao kako se infekcije šire. "Bila je prilika da se pandemija vidi u stvarnom vremenu u mnogo većoj rezoluciji nego što je to ikada prije bilo postignuto", kaže Tom Peacock, virolog s Instituta Pirbright, u blizini Wokinga, Velika Britanija.
Sada, s fazom pandemije u hitnim slučajevima straga - Ogledalo pogleda, virolozi pregledavaju ono što se o virusu može naučiti u tako kratkom vremenu, uključujući i Njegova evolucija i njegove interakcije s ljudskim domaćinima. Evo četiri lekcije iz pandemije za koje neki kažu da bi mogli osnažiti Globalni odgovor na buduće pandemije - ali samo ako su znanstvene i javne - zdravstvene ustanove na mjestu da ih koriste.
Virusni nizovi pričaju priče
Dana 11. siječnja 2020. Edward Holmes, virolog sa Sveučilišta u Sydneyu u Australiji, podijelio je ono što većina znanstvenika smatra prvim SARS - CoV - 2 sekvencom genoma u Odboru za raspravu o virologiji; Podatke je primio od virologa Zhang Yongzhen u Kini.
Do kraja godine, znanstvenici su u spremište poznato podnijeli više od 300 000 sekvenci Globalna inicijativa za dijeljenje svih podataka o gripi (Gisaid). Brzina prikupljanja podataka postala je samo brže od tamo jer su se zabrinjavajuće varijante virusa uhvatile. Neke su zemlje uletele ogromne resurse u sekvenciranje SARS - CoV - 2: Između njih, Ujedinjeno Kraljevstvo i Sjedinjene Države doprinijeli su više od 8,5 milijuna (vidi „Ministarstvo virusnog genoma“). U međuvremenu, znanstvenici u drugim zemljama, uključujući Južnu Afriku, Indiju i Brazil, pokazali su da učinkovit nadzor može uočiti zabrinjavajuće varijante u nižim - resursima.
U ranijim epidemijama, poput izbijanja ebole u zapadnoj Africi 2013–16., Podaci o sekvenciranju ulazili su presporo kako bi se pratilo kako se virus mijenja kako se infekcije šire. Ali brzo je postalo jasno da će SARS - CoV - 2 sekvence doći do neviđenog volumena i tempa, kaže Emma Hodcroft, genomska epidemiologinja na Swiss tropskom i javnom zdravstvenom institutu u Baselu. Ona radi na napor nazvan NextStrain, koji koristi podatke genoma za praćenje virusa, poput gripe, za bolje razumijevanje njihovog širenja. "Razvili smo toliko ovih metoda da bi, u teoriji, mogle biti vrlo korisne", kaže Hodcroft. "I odjednom, 2020. imali smo priliku da se postave i pojavi."
U početku su korišteni SARS - COV - 2 sekvenciranja podataka Pratite širenje virusa u njegovom epicentru U Wuhanu, Kini, a zatim na globalnoj razini. To je odgovorilo na ključna rana pitanja - poput toga je li virus uglavnom proširio između ljudi ili iz istih izvora životinja prema ljudima. Podaci su otkrili geografske načine kroz koje je virus putovao, i pokazali su im mnogo brže nego što bi to mogli uobičajena epidemiološka ispitivanja. Kasnije se počela pojavljivati brže - prijenosna varijanta virusa i poslala laboratorije za sekvenciranje u hiper -vožnju. Globalni kolektiv znanstvenika i amaterskih varijantnih tragača neprestano je progutao podatke o sekvenci u potrazi za zabrinjavajućim promjenama virusa.
"Postalo je moguće pratiti evoluciju ovog virusa ogromno detaljno vidjeti što se točno mijenja", kaže Jesse Bloom, virusni evolucijski biolog iz Centra za rak Fred Hutchinson u Seattleu u Washingtonu. S milijunima SARS - CoV - 2 genoma u ruci, istraživači se sada mogu vratiti i proučiti ih kako bi razumjeli ograničenja evolucije virusa. "To je nešto što nikada prije nismo uspjeli učiniti", kaže Hodcroft.
Virusi se mijenjaju više nego što se očekivalo
Budući da nitko prije nije proučavao SARS - Cov - 2, znanstvenici su došli sa vlastitim pretpostavkama o tome kako će se to prilagoditi. Mnogi su bili vođeni iskustvima s drugim RNA virusom koji uzrokuje respiratorne infekcije: gripa. "Nismo imali puno informacija o drugim respiratornim virusima koji bi mogli uzrokovati pandemije", kaže Hodcroft.
Gripa se uglavnom širi kroz stjecanje mutacijaTo mu omogućava da izbjegne imunitet ljudi. Budući da nitko nikada nije bio zaražen SARS - Cov - 2 prije 2019. godine, mnogi znanstvenici nisu očekivali da će se vidjeti mnogo virusnih promjena sve dok nakon toga nije došlo do znatnog pritiska na njega imunološki sustav ljudi, bilo kroz infekcije ili još bolje, cijepljenje.
Pojava brže - prijenosa, smrtonosnijih varijanti SARS - CoV - 2, poput Alpha i Delta, izbrisala je neke rane pretpostavke. Čak i početkom 2020. godine, SARS - CoV - 2 pokupio je jednu promjenu amino - kiseline koja je značajno pojačala njezino širenje. Mnogi drugi bi slijedili.
"Ono što sam pogriješio i nisam predvidio koliko će se to fenotipično promijeniti", kaže Holmes. "Vidjeli ste ovo nevjerojatno ubrzanje u prenosivosti i virulenciji." Ovo je sugeriralo da SARS - CoV - 2 nije posebno dobro prilagođen širenju između ljudi kada se pojavio u Wuhanu, gradu milijuna. Moglo bi se vrlo dobro izbaciti u manje gusto naseljenom okruženju, dodaje.
Holmes se također pita je li promatrani tempo promatrane promjene samo proizvod kako je praćen blisko SARS - Cov - 2. Bi li istraživači vidjeli istu stopu ako bi gledali pojavu soja gripe koji je bio nov u populaciji, u istoj rezoluciji? To ostaje da se utvrdi.
Početni divovski skokovi koje je SARS - Cov - 2 uzeo došao je s jednom spasiteljskom milošću: nisu drastično utjecali na zaštitni imunitet koji su isporučili cjepiva i prethodne infekcije. Ali to se promijenilo pojavom varijante Omicrona krajem 2021. godine, koja je bila natovarena promjenama proteina 'šiljaka' koja mu je pomogla u izbjegavanju reakcija na antitijela (protein šiljaka omogućava virusu da uđe u stanice domaćina). Znanstvenici poput Blooma bili su iznenađeni kako su se brzo pojavile te promjene u uzastopnim objavama.
A to nije bio čak ni najčudniji aspekt Omicrona, kaže Ravindra Gupta, virolog sa Sveučilišta u Cambridgeu u Velikoj Britaniji. Ubrzo nakon što se pojavila varijanta, njegov tim i drugi primijetili su da su, za razliku od prethodnih SARS - CoV - 2 varijante poput Delta koje su pogodovali donjim - stanicama pluća, Omicron je radije zarazio gornje dišne putove. "Dokumentirati da je virus pomaknuo svoje biološko ponašanje tijekom pandemije bilo je bez presedana", kaže Gupta.
Post Vrijeme: 2025 - 05 - 26 13:59:39
