Kei Sato buscaba o seu próximo gran reto hai cinco anos cando o golpeou - e o mundo - na cara. O virólogo iniciou recentemente un grupo independente na Universidade de Tokio e intentaba esculpir un nicho no concorrido campo da investigación do VIH. "Pensei:" Que podo facer durante os próximos 20 ou 30 anos? ""
Atopou unha resposta en SARS - Cov - 2, o virus responsable da pandemia covid - 19 espallando rapidamente polo mundo. En marzo de 2020, cando os rumores xiraron que Tokio podería enfrontarse a un bloqueo que pararía as actividades de investigación, Sato e cinco estudantes decamitaron ao laboratorio dun ex -asesor en Kyoto. Alí, comezaron a estudar unha proteína viral que Sars - Cov - 2 usa Afundir as primeiras respostas inmunes do corpo. Sato pronto estableceu un consorcio de investigadores que pasarían a publicar polo menos 50 estudos sobre o virus.
En só cinco anos, SARS - Cov - 2 converteuse nun dos virus máis examinados do planeta. Os investigadores publicaron preto de 150.000 artigos de investigación sobre iso, segundo a base de datos de citas Scopus. Isto é aproximadamente tres veces o número de traballos publicados no VIH no mesmo período. Os científicos tamén xeraron máis de 17 millóns de SARS - Cov - 2 secuencias do xenoma ata agora, máis que para calquera outro organismo. Isto deu unha visión inigualable sobre as formas en que o virus cambiou a medida que se estendeu as infeccións. "Houbo unha oportunidade para ver unha pandemia en tempo real en resolución moito máis alta do que antes foi alcanzable", di Tom Peacock, virólogo do Instituto Pirbright, preto de Woking, Reino Unido.
Agora, coa fase de emerxencia da pandemia na parte traseira - Ver o espello, os virólogos están a facer un balance do que se pode aprender sobre un virus nun tempo tan curto, incluído a súa evolución e as súas interaccións cos anfitrións humanos. Aquí tes catro leccións da pandemia que algúns din Resposta global ás futuras pandemias - pero só se as institucións sanitarias e científicas e públicas están en vigor para usalas.
As secuencias virais contan historias
O 11 de xaneiro de 2020, Edward Holmes, virólogo da Universidade de Sydney, Australia, compartiu o que a maioría dos científicos consideran o primeiro SARS - Cov - 2 Secuencia do xenoma a un consello de discusión de viroloxía; Recibira os datos do virólogo Zhang Yongzhen en China.
Ao final do ano, os científicos presentaron máis de 300.000 secuencias a un repositorio coñecido como o Iniciativa global para compartir todos os datos da gripe (Gisaid). A taxa de recollida de datos só foi máis rápida a partir de aí, xa que as variantes preocupantes do virus agarráronse. Algúns países araron enormes recursos para secuenciar SARS - Cov - 2: entre eles, o Reino Unido e os Estados Unidos contribuíron con máis de 8,5 millóns (ver "Rally do xenoma viral"). Mentres tanto, os científicos doutros países, incluídos Sudáfrica, India e Brasil, demostraron que unha vixilancia eficiente pode detectar variantes preocupantes en configuracións de recursos inferiores.
En epidemias anteriores, como o brote de ébola de África occidental 2013-16, os datos de secuenciación chegaron demasiado lentamente para rastrexar como o virus estaba cambiando a medida que se difundía as infeccións. Pero axiña quedou claro que as secuencias SARS - Cov - 2 chegarían a un volume e un ritmo sen precedentes, afirma Emma Hodcroft, epidemióloga xenómica do Instituto Tropical e Saúde Pública suízo de Basilea. Ela traballa un esforzo chamado nextstrain, que usa datos do xenoma para rastrexar virus, como a gripe, para comprender mellor a súa propagación. "Tivemos desenvolvidos tantos destes métodos que, en teoría, poderían ser moi útiles", afirma Hodcroft. "E de súpeto, en 2020, tivemos a oportunidade de poñernos e aparecer."
Inicialmente, utilizáronse SARS - Cov - 2 datos de secuenciación rastrexar a propagación do virus no seu epicentro en Wuhan, China e logo a nivel mundial. Isto respondeu ás primeiras preguntas clave, como se o virus se estendeu en gran medida entre as persoas ou desde as mesmas fontes animais ata os humanos. Os datos revelaron as rutas xeográficas a través das cales viaxaban o virus e mostráronlles moito máis rápido que as investigacións epidemiolóxicas convencionais. Máis tarde, as variantes de transmisión máis rápidas do virus comezaron a aparecer e enviou a secuenciación de laboratorios a hiperdrive. Un colectivo global de científicos e rastreadores de variantes afeccionados arrastrou os datos da secuencia constantemente na procura de cambios virais preocupantes.
"Fíxose posible rastrexar a evolución deste virus en tremendo detalle para ver exactamente o que estaba cambiando", di Jesse Bloom, un biólogo evolutivo viral no Centro de cancro de Fred Hutchinson en Seattle, Washington. Con millóns de SARS - Cov - 2 xenomas na man, os investigadores agora poden volver e estudalos para comprender as restricións da evolución do virus. "Isto é algo que nunca puidemos facer antes", di Hodcroft.
Os virus cambian máis do esperado
Debido a que ninguén estudara SARS - Cov - 2 antes, os científicos viñeron cos seus propios presupostos sobre como se adaptaría. Moitos foron guiados por experiencias con outro virus de ARN que causa infeccións respiratorias: a gripe. "Non tivemos moita información sobre outros virus respiratorios que poderían causar pandemias", di Hodcroft.
A gripe esténdese principalmente a través do Adquisición de mutaciónsIsto permítelle evadir a inmunidade da xente. Debido a que ninguén estivo infectado con SARS - Cov - 2 antes de 2019, moitos científicos non esperaban ver un cambio viral ata despois de que houbese unha presión substancial sobre el polos sistemas inmunitarios da xente, nin por infeccións ou mellor aínda, a vacinación.
A aparición de variantes máis rápidas - transmisor e mortais de SARS - Cov - 2, como Alpha e Delta, eliminou algúns presupostos precoz. Incluso a principios de 2020, SARS - Cov - 2 colleu un único cambio de ácido amino - que aumentou substancialmente a súa propagación. Moitos outros seguirían.
"O que me equivoquei e non anticipou foi canto cambiaría fenotípicamente", di Holmes. "Vostede viu esta sorprendente aceleración en transmisibilidade e virulencia." Isto suxeriu que SARS - Cov - 2 non estaba especialmente ben adaptado á difusión entre a xente cando xurdiu en Wuhan, unha cidade de millóns. Moi ben podería ter esnaquizado nun ambiente menos densamente poboado, engade.
Holmes pregúntase, tamén, se o ritmo de cambio observado foi só un produto de como se rastrexou SARS - Cov - 2. Os investigadores verían a mesma taxa se observasen a aparición dunha cepa de gripe que era nova para a poboación, á mesma resolución? Que queda por determinar.
Os saltos xigantes iniciais que SARS - Cov - 2 tomaron cunha graza salvadora: non afectaron drasticamente a inmunidade protectora entregada polas vacinas e as infeccións anteriores. Pero iso cambiou coa aparición da variante de Omicron a finais de 2021, que estaba cargada de cambios na súa proteína "espiga" que a axudou a esquivar as respostas dos anticorpos (a proteína de espiga permite que o virus entra en células hóspede). Científicos como Bloom foron arrebatados coa rapidez que apareceron estes cambios nas variantes de post - omicron sucesivas.
E ese nin sequera foi o aspecto máis sorprendente de Omicron, afirma Ravindra Gupta, viróloga da Universidade de Cambridge, Reino Unido. Pouco despois de que aparecese a variante, o seu equipo e outros notaron que, a diferenza de SARS anteriores - Cov - 2 variantes como o delta que favoreceron as células inferiores das vías aéreas do pulmón, Omicron preferiu infectar as vías aéreas superiores. "Documentar que un virus cambiou o seu comportamento biolóxico durante o transcurso dunha pandemia sen precedentes", afirma Gupta.
Tempo de publicación: 2025 - 05 - 26 13:59:39
