Kei Sato serĉis sian sekvan grandan defion antaŭ kvin jaroj, kiam ĝi batis lin - kaj la mondon - en la vizaĝo. La Virologo lastatempe komencis sendependan grupon ĉe la Universitato de Tokio kaj klopodis skulpti niĉon en la plenplena kampo de HIV -esplorado. "Mi pensis," Kion mi povas fari dum la venontaj 20 aŭ 30 jaroj? "
Li trovis respondon en SARS - COV - 2, la viruso respondeca pri la Covid - 19 pandemio, tio estis rapide disvastiĝante tra la mondo. En marto 2020, ĉar onidiroj turniĝis, ke Tokio povus alfronti ŝlosilon, kiu ĉesigos esploradajn agadojn, Sato kaj kvin studentoj dekampiĝis al laboratorio de iama konsilisto en Kioto. Tie, ili komencis studi viralan proteinon, kiun SARS - COV - 2 uzas Kvitu la plej fruajn imunajn respondojn de la korpo. Sato baldaŭ establis konsorcion de esploristoj, kiuj daŭriĝus por eldoni almenaŭ 50 studojn pri la viruso.
En nur kvin jaroj, SARS - COV - 2 fariĝis unu el la plej proksime ekzamenitaj virusoj sur la planedo. Esploristoj publikigis ĉirkaŭ 150.000 esplorajn artikolojn pri ĝi, laŭ la cita datumbazo Scopus. Tio estas proksimume trioble la nombro de artikoloj publikigitaj en HIV en la sama periodo. Sciencistoj ankaŭ generis pli ol 17 milionojn da SARS - COV - 2 genomaj sekvencoj ĝis nun, pli ol por iu ajn alia organismo. Ĉi tio donis neegalan vidon pri la manieroj kiel la viruso ŝanĝiĝis dum infektoj disvastiĝis. "Estis ŝanco vidi pandemion en reala tempo en multe pli alta rezolucio ol iam ajn atingebla antaŭe," diras Tom Peacock, virologo de la Instituto Pirbright, proksime de Woking, Britujo.
Nun, kun la kriz -fazo de la pandemio en la malantaŭa - vido -spegulo, virologoj faras bilancon pri tio, kion oni povas lerni pri viruso en tiel mallonga tempo, inkluzive ĝia evoluo kaj ĝiaj interagoj kun homaj gastigantoj. Jen kvar lecionoj el la pandemio, kiujn iuj diras, ke ili povus povigi la Tutmonda respondo al estontaj pandemikoj - sed nur se sciencaj kaj publikaj - sanaj institucioj estas en loko por uzi ilin.
Viralaj sekvencoj rakontas rakontojn
La 11an de januaro 2020, Edward Holmes, virologo ĉe la Universitato de Sidnejo, Aŭstralio, dividis tion, kion plej multaj sciencistoj konsideras la unua SARS - COV - 2 genoma sekvenco al virologia diskut -estraro; Li ricevis la datumojn de Virologo Zhang Yongzhen en Ĉinio.
Je la fino de la jaro, sciencistoj prezentis pli ol 300.000 sekvencojn al deponejo konata kiel la Tutmonda Iniciato pri Dividado de Ĉiuj Influaj Datumoj (Gisaid). La indico de datumkolektado nur pli rapide pli rapide, ĉar maltrankviligaj variantoj de la viruso ekkaptis. Iuj landoj enŝovis enormajn rimedojn al sekvenco SARS - COV - 2: Inter ili, Britio kaj Usono kontribuis pli ol 8,5 milionojn (vidu "Viral Genome Rally"). Dume sciencistoj en aliaj landoj, inkluzive de Sud -Afriko, Barato kaj Brazilo, montris, ke efika gvatado povas rimarki maltrankvilajn variantojn en pli malaltaj - rimedaj agordoj.
En pli fruaj epidemioj, kiel la okcidenta afrika Ebola eksplodo de 2013-16, sekvencaj datumoj venis tro malrapide por spuri kiel la viruso ŝanĝiĝis dum infektoj disvastiĝis. Sed rapide evidentiĝis, ke SARS - COV - 2 -sekvencoj alvenus al senprecedenca volumo kaj ritmo, diras Emma Hodcroft, genoma epidemiologo ĉe la Svisa Tropika kaj Publika Sano -Instituto en Bazelo. Ŝi laboras plu penado nomata nextstrain, kiu uzas genomajn datumojn por spuri virusojn, kiel gripo, por pli bone kompreni ilian disvastiĝon. "Ni estis ellaborintaj tiom da ĉi tiuj metodoj, kiuj teorie povus esti tre utilaj," Hodcroft diras. "Kaj subite, en 2020, ni havis ŝancon aperigi kaj aperi."
Komence, SARS - COV - 2 sekvencaj datumoj kutimis Spuri la disvastiĝon de la viruso ĉe ĝia epicentro en Wuhan, Ĉinio, kaj poste tutmonde. Ĉi tio respondis ŝlosilajn fruajn demandojn - kiel ekzemple ĉu la viruso disvastiĝis plejparte inter homoj aŭ de la samaj bestaj fontoj al homoj. La datumoj malkaŝis la geografiajn itinerojn tra kiuj la viruso vojaĝis, kaj montris al ili multe pli rapide ol povis konvenciaj epidemiologiaj esploroj. Poste, pli rapide - Transdoni variantojn de la viruso ekaperis, kaj sendis sekvencajn laboratoriojn en hiperdrive. Tutmonda kolektivo de sciencistoj kaj amatoraj variantaj spuristoj trapikitaj tra la sekvencaj datumoj konstante serĉante maltrankvilajn viralajn ŝanĝojn.
"Eblis spuri la evoluon de ĉi tiu viruso en terura detalo por vidi ĝuste tion, kio ŝanĝiĝis," diras Jesse Bloom, viral -evolua biologo ĉe la Fred Hutchinson Cancer Center en Seatlo, Vaŝingtono. Kun milionoj da SARS - COV - 2 genomoj en la mano, esploristoj nun povas reiri kaj studi ilin por kompreni la limojn pri la evoluo de la viruso. "Tio estas io, kion ni neniam povis fari antaŭe," diras Hodcroft.
Virusoj ŝanĝiĝas pli ol atendite
Ĉar neniu antaŭe studis SARS - COV - 2 antaŭe, sciencistoj venis kun siaj propraj supozoj pri kiel ĝi adaptiĝos. Multaj estis gvidataj de spertoj kun alia RNA -viruso, kiu kaŭzas spirajn infektojn: gripo. "Ni simple ne havis multajn informojn pri aliaj spiraj virusoj, kiuj povus kaŭzi pandemikojn," diras Hodcroft.
Gripo disvastiĝas ĉefe tra la akiro de mutaciojTio permesas ĝin eskapi de la imuneco de homoj. Ĉar neniu iam estis infektita de SARS - COV - 2 antaŭ 2019, multaj sciencistoj ne atendis vidi multan viralan ŝanĝon ĝis post kiam estis grava premo sur ĝi de la imunsistemoj de homoj, ĉu per infektoj aŭ pli bone, vakcinado.
La apero de pli rapida - Transdono, pli mortigaj variantoj de SARS - COV - 2, kiel alfa kaj delta, forprenis iujn fruajn supozojn. Eĉ komence de 2020, SARS - COV - 2 reprenis ununuran amino - acida ŝanĝo, kiu substance akcelis sian disvastiĝon. Multaj aliaj sekvus.
"Kion mi eraris kaj ne antaŭvidis estis ĝuste kiom ĝi ŝanĝus fenotipie," diras Holmes. "Vi vidis ĉi tiun mirigan akcelon en transmisibilidad kaj virulenco." Ĉi tio sugestis, ke SARS - COV - 2 ne estis speciale adaptita al disvastigado inter homoj kiam ĝi aperis en Wuhan, urbo de milionoj. Ĝi povus tre bone ekbruliĝi en malpli dense loĝata aranĝo, li aldonas.
Holmes scivolas, ĉu la rompa ritmo de observita ŝanĝo estis nur produkto de kiom proksime SARS - COV - 2 estis spurita. Ĉu esploristoj vidus la saman indicon se ili spektus la aperon de gripo -streĉo, kiu estis nova por la loĝantaro, kun la sama rezolucio? Tio restas por determini.
La komencaj gigantaj saltoj, kiujn Sars - Cov - 2 prenis kun unu ŝparanta graco: ili ne draste influis la protektan imunecon liveritan de vakcinoj kaj antaŭaj infektoj. Sed tio ŝanĝiĝis kun la apero de la Omicron -varianto fine de 2021, kiu estis ŝarĝita per ŝanĝoj al ĝia proteino "spico", kiu helpis ĝin eskapi respondojn de antikorpoj (la proteino Spike permesas al la viruso eniri gastigajn ĉelojn). Sciencistoj kiel Bloom estis kaptitaj pri kiom rapide ĉi tiuj ŝanĝoj aperis en pluaj post - Omicron -variantoj.
Kaj tio eĉ ne estis la plej mirinda aspekto de Omicron, diras Ravindra Gupta, virologo de la Universitato de Kembriĝo, Britujo. Baldaŭ post kiam la varianto aperis, lia teamo kaj aliaj rimarkis, ke male al antaŭaj variantoj de SARS - COV - 2 kiel Delta, kiuj favoris la malsuperajn - aerajn ĉelojn de la pulmo, Omicron preferis infekti la suprajn aerajn vojojn. "Dokumenti, ke viruso ŝanĝis sian biologian konduton dum la kurso de pandemio estis senprecedenca," diras Gupta.
Afiŝotempo: 2025 - 05 - 26 13:59:39
