Kei Sato buscava el seu següent gran repte fa cinc anys quan el va fer un cop de mà a la cara. El viròleg havia iniciat recentment un grup independent a la Universitat de Tòquio i estava intentant tallar un nínxol en el camp concorregut de la investigació del VIH. "Vaig pensar:" Què puc fer durant els propers 20 o 30 anys? "
Va trobar una resposta a Sars - Cov - 2, el virus responsable de la pandèmia Covid - 19 es va estendre ràpidament pel món. Al març del 2020, mentre els rumors van girar que Tòquio podria afrontar un bloqueig que aturés les activitats de recerca, Sato i cinc estudiants es van decapar al laboratori d'un antic assessor de Kyoto. Allà, van començar a estudiar una proteïna viral que sars - cov - 2 uses Alleugiu les primeres respostes immunes del cos. Sato aviat va establir un consorci d’investigadors que passaria a publicar almenys 50 estudis sobre el virus.
En només cinc anys, Sars - Cov - 2 es va convertir en un dels virus més examinats del planeta. Els investigadors han publicat prop de 150.000 articles de recerca al respecte, segons la base de dades de cites Scopus. És aproximadament tres vegades el nombre de treballs publicats al VIH en el mateix període. Els científics també han generat més de 17 milions de seqüències del genoma SARS - 2 fins ara, més que per a qualsevol altre organisme. Això ha donat una visió inigualable sobre les maneres de canviar el virus a mesura que es propaga les infeccions. "Hi va haver l'oportunitat de veure una pandèmia en temps real en una resolució molt superior a la que s'havia aconseguit abans", afirma Tom Peacock, viròleg del Pirbright Institute, a prop de Woking, Regne Unit.
Ara, amb la fase d’emergència de la pandèmia al mirall posterior de la vista, els viròlegs estan fent un balanç del que es pot aprendre sobre un virus en tan poc temps, inclòs la seva evolució i les seves interaccions amb els amfitrions humans. A continuació, es mostren quatre lliçons de la pandèmia que alguns diuen que podrien apoderar el Resposta global a les futures pandèmies - Però només si hi ha institucions científiques i públiques - Salut per utilitzar -les.
Les seqüències virals expliquen històries
L’11 de gener de 2020, Edward Holmes, viròleg de la Universitat de Sydney, Austràlia, va compartir el que la majoria dels científics consideren que és la primera seqüència del genoma SARS - 2 a un tauler de discussió de virologia; Havia rebut les dades del viròleg Zhang Yongzhen a la Xina.
Al final de l'any, els científics havien enviat més de 300.000 seqüències a un dipòsit conegut com a Iniciativa global sobre compartir totes les dades de la grip (Gisaid). La taxa de recollida de dades només es va fer més ràpida a mesura que es va fer retallar les variants inquietants del virus. Alguns països van llaurar enormes recursos per seqüenciar SARS - Cov - 2: Entre ells, el Regne Unit i els Estats Units van aportar més de 8,5 milions (vegeu "Ral·li del genoma viral"). Mentrestant, els científics d’altres països, inclosos Sud -àfrica, l’Índia i el Brasil, van demostrar que una vigilància eficient pot detectar variants preocupants en els entorns de recursos inferiors.
En les epidèmies anteriors, com el brot de l’Ebola de l’Àfrica de l’Àfrica 2013-16, les dades de seqüenciació es van produir massa lentament per fer un seguiment de com canviava el virus a mesura que s’estenia les infeccions. Però ràpidament es va fer evident que les seqüències SARS - COV - 2 arribarien a un volum i un ritme sense precedents, afirma Emma Hodcroft, una epidemiòloga genòmica de l’Institut Tropical i de Salut Pública suïssa de Basilea. Ella treballa Un esforç anomenat NextStrain, que utilitza dades del genoma per fer un seguiment dels virus, com la grip, per entendre millor la seva propagació. "Havíem desenvolupat tants d'aquests mètodes que, en teoria, podrien haver estat molt útils", afirma Hodcroft. "I de sobte, el 2020, vam tenir l'oportunitat de plantejar -nos i presentar -nos."
Inicialment, es van utilitzar dades de seqüenciació SARS - COV - 2 rastrejar la propagació del virus al seu epicentre a Wuhan, Xina, i després a nivell mundial. Això va respondre a preguntes primerenques, com ara si el virus es va estendre en gran mesura entre persones o des de les mateixes fonts animals fins als humans. Les dades van revelar les rutes geogràfiques a través de les quals va viatjar el virus i les mostraven molt més ràpidament que les investigacions epidemiològiques convencionals. Posteriorment, va començar a aparèixer variants de transmissió més ràpida del virus i van enviar laboratoris de seqüenciació a Hyperdrive. Un col·lectiu global de científics i rastrejadors de variants aficionats es van arrossegar a través de les dades de la seqüència constantment a la recerca de canvis virals preocupants.
"Va ser possible fer un seguiment de l'evolució d'aquest virus amb detalls enormes per veure exactament què canviava", afirma Jesse Bloom, biòleg evolutiu viral del Fred Hutchinson Cancer Center de Seattle, Washington. Amb milions de genomes SARS - COV - 2 a la mà, els investigadors ara poden tornar enrere i estudiar -los per entendre les restriccions de l'evolució del virus. "Això és una cosa que mai no havíem pogut fer", diu Hodcroft.
Els virus canvien més del que s’esperava
Com que ningú no havia estudiat mai SARS - Cov - 2, els científics van venir amb els seus propis supòsits sobre com s’adaptaria. Molts es van guiar per experiències amb un altre virus de l’ARN que causa infeccions respiratòries: la grip. "Simplement no teníem gaire informació sobre altres virus respiratoris que podrien provocar pandèmies", afirma Hodcroft.
La grip es propaga principalment pel adquisició de mutacionsAixò li permet evadir la immunitat de la gent. Com que ningú no s’havia infectat mai amb SARS - COV - 2 abans del 2019, molts científics no esperaven veure gaire canvis virals fins que després hi hagués una pressió substancial que els sistemes immunitaris de la gent, ja sigui a través d’infeccions o millor encara, vacunació.
L’aparició de les variants de transmissió més ràpida i mortal de Sars - Cov - 2, com Alpha i Delta, van oblidar algunes hipòtesis primerenques. Fins i tot a principis del 2020, SARS - COV - 2 havia recollit un sol canvi d'àcid que va augmentar substancialment la seva propagació. Molts altres seguirien.
"El que em vaig equivocar i no preveia que era el que canviaria fenotípicament", afirma Holmes. "Heu vist aquesta sorprenent acceleració en transmissibilitat i virulència." Això va suggerir que Sars - Cov - 2 no estava especialment ben adaptat a la difusió entre la gent quan va sorgir a Wuhan, una ciutat de milions. Podria haver -se acabat en un entorn menys densament poblat, afegeix.
Holmes es pregunta, també, si el ritme de canvi del canvi observat era només un producte de la proximitat de Sars - Cov - 2. Els investigadors veurien la mateixa taxa si miressin l’aparició d’una soca de la grip que era nova per a la població, a la mateixa resolució? Queda per determinar.
Els salts gegants inicials que Sars - Cov - 2 va arribar a una gràcia salvadora: no van afectar dràsticament la immunitat protectora que van lliurar les vacunes i les infeccions anteriors. Però això va canviar amb l’aparició de la variant d’omicron a finals del 2021, que es va enganxar amb canvis a la seva proteïna “espiga” que l’ha ajudat a esquivar les respostes d’anticossos (la proteïna Spike permet al virus entrar a cèl·lules hostes). Científics com Bloom han estat afectats per la rapidesa amb què van aparèixer aquests canvis en les successives variants post - omicron.
I aquest no va ser ni tan sols l’aspecte més sorprenent d’Omicron, afirma Ravindra Gupta, viròloga de la Universitat de Cambridge, Regne Unit. Poc després de la variant, el seu equip i altres es van adonar que, a diferència de les anteriors SARS - Cov - 2 variants com el delta que afavoreixen les cèl·lules de les vies respiratòries inferiors del pulmó, Omicron preferia infectar les vies respiratòries superiors. "Documentar que un virus va canviar el seu comportament biològic durant el transcurs d'una pandèmia no tenia precedents", afirma Gupta.
Hora del missatge: 2025 - 05 - 26 13:59:39
