Kei Sato je tražio svoj sljedeći veliki izazov prije pet godina kada ga je pobijedio - i svijet - u lice. Virolog je nedavno započeo nezavisnu grupu na Univerzitetu u Tokiju i pokušavao je izrezati nišu u prepunom polju HIV istraživanja. "Mislio sam:" Šta mogu učiniti za narednih 20 ili 30 godina? ""
Našao je odgovor na SARS-u - CUV - 2, virus odgovoran za Covid - Pandemic, to je bilo brzo se širi širom svijeta. U martu 2020. godine, glasine su se okretali da se Tokio može suočiti sa zaključavanjem koji bi zaustavili istraživačke aktivnosti, SATO i pet učenika dekomirali su u bivšu laboratoriju sa savjetnikom u Kjotu. Eto, počeli su proučavati virusni protein koji SARS - TUV - 2 koristi quell najraniji imunološki odgovori u tijelu. Sato je ubrzo uspostavio konzorcijum istraživača koji bi se navijali da objavljuju najmanje 50 studija na virusu.
Za samo pet godina SARS - CUV - 2 je postao jedan od najskročnije ispitanih virusa na planeti. Istraživači su objavili oko 150 000 istraživačkih članaka o tome, navodi se u Scopusu baze podataka citata. To je otprilike tri puta veći broj radova koji se objavljuju na HIV-u u istom periodu. Naučnici su također generirali više od 17 miliona SARS-a - Cov - 2 genoma za do sada, više nego za bilo koji drugi organizam. Ovo je dalo neusporediv pogled na načine na koji se virus promijenio kao infekcije širenje. "Bila je prilika da se pandemija u stvarnom vremenu vide u mnogo veću rezoluciju nego što je ikada ranije ostvariv", kaže Tom Peacock, virus na Pirbright Institutu, u blizini Wokinga, Velika Britanija.
Sada, sa hitnom fazom pandemije u stražnjem - pogledajte ogledalo, virolozi preuzimaju skladište onoga što se može naučiti o virusu u tako kratkom roku, uključujući njegova evolucija i njegove interakcije sa ljudskim domaćinima. Evo četiri lekcije iz pandemije koje neki kažu da bi mogle osnažiti Globalni odgovor na buduće pandemije - Ali samo ako su naučne i javne zdravstvene ustanove na mestu da ih koriste.
Virusne sekvence pričaju priče
Dana 11. januara 2020., Edward Holmes, virus na Univerzitetu u Sydneyu, Australija, podijelio je ono što većina naučnika smatraju prvim SARS-om - CUV - 2 GENOME redoslijed odbora za diskusiju o vinologiji; Primio je podatke virologa Zhang Yongzhen u Kini.
Dogodišnjeg kraja, naučnici su podneli više od 300.000 sekvenci u spremište poznatu kao Globalna inicijativa o dijeljenju svih podataka gripa (Gisaid). Stopa prikupljanja podataka dobila se samo odatle kao zabrinjavajuće varijante virusa. Neke su zemlje orušile ogromne resurse u sekvenciranje SARS-a - CUV - 2: Između njih, Velika Britanija i Sjedinjene Države doprinijele su više od 8,5 miliona (vidi "virusni mirur"). U međuvremenu, naučnici u drugim zemljama, uključujući Južnu Afriku, Indiju i Brazil, pokazali su da efikasan nadzor može zabrinjavati zabrinjavajuće varijante u nižim - postavkama resursa.
U ranijim epidemijama, poput izbijanja zapadnoafričke ebole 2013-16, redoslijedni podaci su se prevozili za praćenje kako se virus mijenjao kao infekcije. Ali brzo je postalo jasno da bi SARS - COV - 2 sekvence stići na neviđeni volumen i tempo, kaže Emma Hodcroft, genomski epidemiolog na švicarskom tropskom i javnom zavodu u Bazelu. Radi na napor koji se zove Nextstrain, koji koristi genome podatke za praćenje virusa, poput gripa, kako bi se bolje razumio njihovo širenje. "Razvili smo toliko ovih metoda da bi u teoriji mogle biti vrlo korisne", kaže Hodcroft. "I odjednom smo 2020. godine imali priliku da se postavimo i pojavimo."
Prvobitno, SARS - CUV - 2 Podaci sekvenciranja pratiti širenje virusa u svom epicentru u Wuhan, Kini, a zatim globalno. Ovo je odgovorilo ključna rana pitanja - kao što je virus uglavnom širen između ljudi ili iz istih izvora životinja za ljude. Podaci su otkrili geografske rute kroz koje je virus putovao i pokazao im mnogo brže nego što bi mogle konvencionalne epidemiološke istrage moći. Kasnije su brže - odašiljačke varijante virusa počele pojavljivati i poslali redoslijed laboratorija u hiperdrive. Globalni kolektiv naučnika i amaterskih varijantnih praćenja koji se neprestano provalio kroz podatke sekvence u potrazi za zabrinutim virusnim promjenama.
"To je postalo moguće u potpunom pratiti evoluciju ovog virusa da se tačno vidi šta se mijenjalo", kaže Jesse Bloom, virusni evolucijski biolog u centru Fred Hutchinson u Seattlu, Washington. Sa milionima SARS-a - Cov - 2 genoma u ruci, sada se istraživači mogu vratiti i proučavati ih kako bi razumjeli ograničenja u evoluciji virusa. "To je nešto što nikad ranije možemo učiniti", kaže Hodcroft.
Virusi se mijenjaju više nego što se očekivalo
Jer niko nikada nije studirao SARS - CUV - prije 2, naučnici su došli sa vlastitim pretpostavkama o tome kako bi se prilagodio. Mnogi su bili vođeni iskustvima sa drugim RNA virusom koji uzrokuje respiratorne infekcije: grip. "Mi jednostavno nismo imali mnogo informacija o drugim respiratornim virusima koji mogu izazvati pandemiju", kaže Hodcroft.
Gripa se širi uglavnom kroz Stjecanje mutacijaTo omogućava da izbjegava imunitet ljudi. Jer niko nikada nije zaražen SARS-om - 2. prije 2019. godine, mnogi naučnici nisu očekivali da će vidjeti mnogo virusne promjene sve dok se ne dođe do značajnog pritiska na njenim imunološkim sistemima, bilo kroz infekcije ili još bolje, još uvijek vakcinacije.
Pojava bržeg - prenošenja, varijante mrtvih krila SARS - CUV - 2, poput Alpha i Delta, izbrisali su neke rane pretpostavke. Čak i početkom 2020. godine, SARS - COV - 2 pokupio je jednu aminonu promjenu kiseline koja su značajno pojačala svoje širenje. Pratili bi mnogi drugi.
"Ono što sam poželo po zlu i nisam predvidio da će se dosta toga mijenjati fenotipno", kaže Holmes. "Vidjeli ste ovo nevjerojatno ubrzanje u prenosnosti i virulenciji." Ovo je sugeriralo da SARS - Cov - 2 nije posebno dobro prilagođen širivanju između ljudi kada se pojavio u Wuhanu, gradu milijuna. Moglo bi se vrlo dobro izviti u manje gusto naseljenom okruženju, dodaje.
Holmes se čuda, također, da li je Breaking Tempo promatrane promjene bio samo proizvod koliko je praćen blisko SARS - CUV - 2. Da li bi istraživači vidjeli istu stopu ako su gledali nastan naprezanje napeta gripe koji je bio novi stanovništvu, istog rezolucije? Ostaje da se utvrdi.
Početni divovski skokovi koji su SARS - CUV - 2 došao sa jednom uštedom Grace: Nisu drastično utjecali na zaštitni imunitet koji je isporučio vakcine i prethodne infekcije. Ali to se promijenilo sa pojavom varijante Omicrona krajem 2021. godine, što je zatočeno sa promjenama svog proteina 'Spike' koji su mu pomogli da izbjegne odgovore protiv antitela (Spike protein omogućava virusu u ulazak u ćelije host). Naučnici poput Croom-a oduzeli su se u tome koliko su se ti promjene brzo pojavile u uzastopnom postu - omikronskim varijantama.
A to nije bio ni najopređeniji aspekt Omicrona, kaže Ravindra Gupta, virus na Univerzitetu u Cambridgeu, Velika Britanija. Ubrzo nakon što je varijanta pojavila, njegov tim i drugi primijetili su to, za razliku od prethodnih SARS-a - cov - 2 varijante poput delte koji su favorizirali donju željenu ćelije pluća, omicron je radije zarazila na gornje dišne puteve. "Da dokumentiram da je virus pomaknuo svoje biološko ponašanje tokom pandemije, bio je bez presedana", kaže Gupta.
Pošta: 2025 - 05 - 26 13:59:39
