Кей Сато шукаў свой наступны вялікі выклік пяць гадоў таму, калі ён ударыў яго - і свет - у твар. Нядаўна віролаг стварыў незалежную групу ва ўніверсітэце Токіо і спрабаваў выразаць нішу ў шматлюднай галіне даследаванняў па ВІЧ. "Я падумаў:" Што я магу зрабіць на працягу наступных 20 ці 30 гадоў? "
Ён знайшоў адказ у SARS - cov - 2, вірус, які адказвае за Covid - 19 пандэмію, гэта было хутка распаўсюджваецца па ўсім свеце. У сакавіку 2020 года, калі чуткі закруціліся, што Токіо можа сутыкнуцца з блакіроўкай, які спыніць навукова -даследчую дзейнасць, Сато і пяць студэнтаў, якія распачаліся ў лабараторыю былога саветніка ў Кіёта. Там яны пачалі вывучаць вірусны бялок, які выкарыстоўваецца для SARS - Cov - 2 спыніць самыя раннія імунныя рэакцыі цела. У хуткім часе Сато стварыў кансорцыум даследчыкаў, які будзе публікаваць як мінімум 50 даследаванняў па вірусе.
Усяго за пяць гадоў SARS - cov - 2 стаў адным з найбольш цесна разгледжаных вірусаў на планеце. Згодна з базай дадзеных Scopus Scopus Scopus, даследчыкі апублікавалі каля 150 000 артыкулаў аб даследаваннях. Гэта прыблізна ў тры разы больш, чым колькасць дакументаў, апублікаваных на ВІЧ у той жа перыяд. Навукоўцы таксама стварылі больш за 17 мільёнаў SARS - Cov - 2 паслядоўнасці генома да гэтага часу, больш, чым для любога іншага арганізма. Гэта дало неперасягнены выгляд у тым, як вірус змяніўся па меры распаўсюджвання інфекцый. "Была магчымасць убачыць пандэмію ў рэжыме рэальнага часу ў значна больш высокім дазволе, чым калі -небудзь было раней", - кажа Том Паўлін, віролаг Інстытута Пірбрайта, недалёка ад Уокінга, Вялікабрытанія.
Цяпер, з аварыйнай фазай пандэміі ў задняй яго эвалюцыя і яго ўзаемадзеянне з чалавечымі гаспадарамі. Вось чатыры ўрокі з пандэміі, якія, як кажуць, некаторыя могуць пашырыць магчымасці Глабальны адказ на будучыя пандэмікі - але толькі ў тым выпадку, калі навуковыя і грамадскія - Інстытуты аховы здароўя існуюць для іх выкарыстання.
Вірусныя паслядоўнасці распавядаюць гісторыі
11 студзеня 2020 года Эдвард Холмс, вірус з Універсітэта Сіднэя, Аўстралія, падзяліўся тым, што большасць навукоўцаў лічаць першым SARS - Cov - 2 паслядоўнасцю геному ў савеце дыскусіі вірусалогіі; Ён атрымаў дадзеныя ад віруса Чжан Йонжэн у Кітаі.
Да канца года навукоўцы прадставілі больш за 300 000 паслядоўнасцей у сховішча, вядомае як Глабальная ініцыятыва па абмене ўсімі дадзенымі грыпу (GISAID). Хуткасць збору дадзеных толькі адтуль узнікла, паколькі выклікалі трывожныя варыянты віруса. Некаторыя краіны ўзаралі велізарныя рэсурсы ў паслядоўнасць SARS - cov - 2: Паміж імі Вялікабрытанія і ЗША ўнеслі больш за 8,5 мільёна (гл. "Вірусны геном"). Між тым, навукоўцы ў іншых краінах, у тым ліку Паўднёвай Афрыкі, Індыі і Бразіліі, паказалі, што эфектыўнае назіранне можа заўважыць трывожныя варыянты ў ніжніх умовах рэсурсаў.
У папярэдніх эпідэміі, напрыклад, заходнеафрыканскай эпідэміі заходняй Афрыкі 2013–16 гадоў, дадзеныя аб секвенирования паступалі занадта павольна, каб адсочваць, як вірус мяняецца па меры распаўсюджвання інфекцый. Але хутка стала зразумела, што SARS - cov - 2 паслядоўнасці прыйдуць да беспрэцэдэнтнага аб'ёму і тэмпу, кажа Эма Ходкрофт, геномны эпідэміёлаг Швейцарскага інстытута трапічнага і грамадскага аховы здароўя ў Базелі. Яна працуе далей намаганні пад назвай NextStrain, які выкарыстоўвае дадзеныя генома для адсочвання вірусаў, такіх як грып, каб лепш зразумець іх распаўсюджванне. "Мы распрацавалі так шмат гэтых метадаў, што тэарэтычна магло быць вельмі карысным", - кажа Ходкрофт. "І раптам у 2020 годзе ў нас была магчымасць паставіць і з'явіцца".
Першапачаткова былі выкарыстаны SARS - Cov - 2 дадзеныя паслядоўнасці былі выкарыстаны Прасачыце распаўсюджванне віруса на яго эпіцэнтр у Вухане, Кітай, а потым ва ўсім свеце. Гэта адказала на ключавыя раннія пытанні - напрыклад, ці распаўсюджваецца вірус у значнай ступені паміж людзьмі ці ад тых жа крыніц жывёл да чалавека. Дадзеныя выявілі геаграфічныя шляхі, па якіх вірус падарожнічаў, і паказалі ім значна хутчэй, чым маглі звычайныя эпідэміялагічныя даследаванні. Пазней, хутчэй, - Перадача варыянтаў віруса пачалі з'яўляцца і адпраўлялі лабараторыі паслядоўнасці ў HyperDrive. Глабальны калектыў навукоўцаў і аматарскіх варыянтаў трэкераў праходзіў праз дадзеныя паслядоўнасці ў пошуках трывожных вірусных змен.
"Стала магчымасць адсачыць эвалюцыю гэтага віруса ў велізарных дэталях, каб даведацца, што менавіта змяняецца", - кажа Джэсі Блум, вірусны эвалюцыйны біёлаг у Цэнтры рака Фрэда Хатчынсана ў Сіэтле, штат Вашынгтон. З мільёнамі SARS - Cov - 2 геномы ў руках, даследчыкі могуць вярнуцца і вывучыць іх, каб зразумець абмежаванні эвалюцыі віруса. "Гэта тое, чаго мы ніколі раней не змаглі зрабіць", - кажа Ходкрофт.
Вірусы мяняюцца больш, чым чакалася
Паколькі ніхто ніколі не вывучаў SARS - Cov - 2 раней, навукоўцы прыйшлі са сваімі ўласнымі здагадкамі пра тое, як ён адаптаваўся. Шмат хто кіраваўся вопытам з іншым вірусам РНК, які выклікае рэспіраторныя інфекцыі: грып. "У нас проста не было шмат інфармацыі пра іншыя дыхальныя вірусы, якія могуць выклікаць пандэміку", - кажа Ходкрофт.
Грып распаўсюджваецца ў асноўным праз Набыццё мутацыйГэта дазваляе яму ўхіляцца ад імунітэту людзей. Паколькі ніхто ніколі не быў заражаны SARS - Cov - 2 да 2019 года, многія навукоўцы не чакалі, што ўбачаць вялікія вірусныя змены, пакуль пасля імуннай сістэмы людзей імунная сістэма людзей не аказалі істотнага ціску.
З'яўленне больш хуткага - перадачы, смяротных варыянтаў SARS - cov - 2, напрыклад, альфа і дэльта, знішчыў некаторыя раннія здагадкі. Нават да пачатку 2020 года SARS - cov - 2 падняла адзінае аміна - змяненне кіслаты, якая істотна павялічыла яго распаўсюджванне. Многія іншыя будуць сачыць.
"Тое, што я памыліўся, і не меркаваў, што гэта можа змяніцца фенатыпічна", - кажа Холмс. "Вы бачылі гэта дзіўнае паскарэнне ў праходжанні і вірулентнасці". Гэта дазваляе выказаць здагадку, што SARS - cov - 2 не быў асабліва добра прыстасаваны да распаўсюджвання паміж людзьмі, калі ён з'явіўся ў Ухане, горадзе мільёнаў. Гэта цалкам можа зарэзаць у менш густанаселенай абстаноўцы, дадае ён.
Холмс таксама задумваецца, ці быў ударны тэмп назіраных змяненняў толькі прадуктам таго, як адсочваліся ўважлівасці - cov - 2. Ці бачаць даследчыкі аднолькавую стаўку, калі б назіралі за ўзнікненнем штаму грыпу, які быў новым для насельніцтва, у той жа рэзалюцыі? Гэта яшчэ трэба будзе вызначыць.
Першапачатковы гіганцкі скачок, які прыняў SARS - Cov - 2, прыйшоў з адной выратавальнай грацыяй: яны не рэзка паўплывалі на ахоўны імунітэт, які забяспечваецца вакцынамі і папярэднімі інфекцыямі. Але гэта змянілася з з'яўленнем варыянту Omicron у канцы 2021 года, які быў нагружаны з зменамі ў яго "шыпавым" бялку, які дапамог яму ўхіляцца ад рэакцый антыцелаў (бялок Spike дазваляе вірусу ўвайсці ў клеткі гаспадара). Такія навукоўцы, як Bloom, былі здзіўлены тым, наколькі хутка гэтыя змены з'явіліся ў наступным паведамленні - Omicron варыянты.
І гэта нават не самы дзіўны аспект Omicron, кажа Равіндра Гупта, вірус з Кембрыджскага універсітэта, Вялікабрытанія. Неўзабаве пасля таго, як з'явіўся варыянт, яго каманда і іншыя заўважылі, што, у адрозненне ад папярэдніх SARS - cov - 2 варыянты, такія як Delta, якія спрыялі ніжнім - дыхальнымі клеткамі лёгкіх, Omicron аддаваў перавагу заразіць верхнія дыхальныя шляхі. "Дакументуе, што вірус зрушыў сваё біялагічнае паводзіны падчас пандэміі, быў беспрэцэдэнтным", - кажа Гупта.
Час паведамлення: 2025 - 05 - 26 13:59:39
